Kamis 04 Aug 2022 03:02 WIB

Kecerdasan Buatan Prediksi Struktur Hampir Setiap Protein yang Pernah Ditemukan

Dengan memahami lipatan tertentu, ilmuwan dapat memahami bagaimana protein beroperasi

Rep: Noer Qomariah Kusumawardhani/ Red: Friska Yolandha
Struktur protein.
Foto:

Menurut EMBL-EBI, sekitar sepertiga dari lebih dari 214 juta prediksi telah diklasifikasikan sebagai sangat akurat, setara dengan struktur protein yang berasal dari metode eksperimental biasa, seperti kristalografi sinar-X dan mikroskopi cryo-electron.

Selama beberapa dekade para ilmuwan telah dengan susah payah menyimpulkan struktur molekul dari gambar kabur yang dihasilkan metode ini - mungkin yang paling terkenal adalah gambar DNA heliks Rosalind Franklin. Namun, kualitas prediksi AlphaFold bervariasi, dan mungkin kurang akurat untuk protein langka yang hanya sedikit diketahui para ilmuwan. Jadi dalam beberapa kasus, struktur prediksinya dapat digunakan untuk memahami data eksperimen.

Terlepas dari dump data yang sangat besar, masih ada banyak kehidupan yang tidak ditangkap AlphaFold, termasuk prediksi tentang bagaimana protein berinteraksi setelah dirakit. Protein mikroba yang diidentifikasi dari jejak materi genetik di tanah dan air laut juga tidak ada dalam database – namun mikroorganisme ini mewakili sumber senyawa kuat yang belum dimanfaatkan, karena para ilmuwan telah membuat katalog hanya sebagian kecil dari semua kehidupan mikroba di Bumi.

Beberapa ilmuwan juga telah menyuarakan keprihatinan tentang aksesibilitas database AlphaFold dan kontennya yang mengejutkan sebesar 23 terabyte, yang mungkin kurang layak untuk diakses oleh beberapa tim peneliti mengingat daya komputer yang mahal dan penyimpanan berbasis cloud yang dibutuhkan analisis data yang canggih. Meskipun demikian, manfaat yang akan datang bagi kesehatan manusia - yang menurut DeepMind telah dipertimbangkan dengan cermat terhadap potensi risiko bioetika - begitu besar sehingga hampir tidak terbayangkan.

“Saya berharap pembaruan terbaru ini akan memicu serangkaian penemuan baru dan menarik di bulan-bulan dan tahun-tahun mendatang,” kata ahli biologi struktural dan ilmuwan senior EMBL-EBI, Dame Janet Thornton kepada The Guardian. “Dan ini semua berkat fakta bahwa data tersedia secara terbuka untuk digunakan semua orang.” DeepMind dan EMBL-EBI akan terus memperbarui database AlphaFold secara berkala.

Advertisement
Berita Lainnya
Advertisement
Terpopuler
1
Advertisement
Advertisement