REPUBLIKA.CO.ID, BERLIN -- Ilmuwan mengawetkan paru-paru manusia yang sakit campak dengan formalin selama lebih dari 100 tahun. Pengawetan ini membantu para ilmuwan melacak sejarah virus campak. Hasilnya, virus ini mungkin berasal dari abad keenam SM.
Selama bertahun-tahun, paru-paru yang diawetkan tersebut berada di ruang bawah tanah Museum Sejarah Medis Berlin bersama dengan ratusan spesimen paru-paru lainnya. Semuanya dikumpulkan dan disimpan antara tahun 1870-an dan 1930-an.
Pada perburuan untuk patogen pernapasan yang terpelihara dengan baik, ahli virologi Sébastien Calvignac-Spencer dari Robert Koch Institute dan tim peneliti turun ke ruang bawah tanah dan mengintip ke dalam setiap toples.
"Ini kebetulan bahwa tim menemukan paru-paru milik seorang pasien campak berusia 2 tahun yang meninggal akibat penyakit tersebut pada tahun 1912," kata Calvignac-Spencer dilansir di Live Science, Jumat (19/6).
Tim berhasil mengekstraksi sampel virus dari jaringan paru berusia 108 tahun. Ilmuwan berhasil mengurutkan genom campak tertua untuk mempelajari lebih lanjut tentang asal-usul patogen. Menurut Calvignac-Spencer perkiraan baru menunjukkan bahwa virus campak mungkin lebih dari 1.000 tahun lebih tua dari perkiraan sebelumnya.
Dalam sebuah studi baru, yang diterbitkan Kamis (18/6) dalam jurnal Science, ilmuwan memperkirakan bahwa campak 'menyimpang' dari kerabat terdekatnya yakni virus ternak rinderpest pada awal tahun 528 SM.
Studi sebelumnya memperkirakan bahwa campak dan virus ternak rinderpest, 'terpisah' antara abad ke-11 dan ke-12. Rinderpest adalah campak yang menyerang pada hewan. Studi ini dilaporkan tahun 2011 dalam jurnal Molecular Biology and Evolution (MBE).
"Perpecahan antara campak dan rinderpest jelas diremehkan," kata Joel Wertheim, penulis laporan MBE dan asisten profesor kedokteran di Universitas California, San Diego, yang tidak terlibat dalam studi Sains yang baru.
"Meremehkan ini muncul dari dua masalah kritis: kurangnya sampel campak lama dan asumsi yang salah tentang bagaimana virus bermutasi melalui waktu, yang condong model evolusi menuju penanggalan yang sangat baru," kata Wertheim.
Wertheim dan rekan penulisnya membangun model baru untuk memperhitungkan faktor-faktor ini dan mendorong kembali tanggal asal ke akhir abad kesembilan. "Tetapi kami tidak berpikir kami benar," katanya.
Sekarang, Calvignac-Spencer dan timnya telah mencapai perkiraan yang lebih realistis, sebagian, dengan memasukkan spesimen 1912 yang baru ditemukan dalam analisis mereka.
Sebelum tim menemukan sampel 1912, genom campak tertua yang pernah diurutkan pada tahun 1954. Para ilmuwan memperkirakan laju perubahan evolusioner, atau seberapa banyak dan seberapa cepat virus bermutasi, dengan membandingkan sampel yang dikumpulkan pada waktu yang berbeda dan melacak perbedaan dalam kode genetik mereka. Semakin banyak sampel yang diteliti, semakin jelas tingkat perubahannya.
'Nyawa' virus campak adalah RNA, sejenis materi genetik yang terdegradasi dengan cepat dibandingkan dengan DNA. Sampel 1912 ini lolos karena paru-paru telah diperbaiki dalam formalin. Pengawet yang menghentikan reaksi kimia sehingga tidak merusak RNA virus.
"Formalin juga merekatkan RNA yang diawetkan ke molekul terdekat, sehingga sulit untuk diekstraksi," kata Calvignac-Spencer.
Untuk menghapuskan RNA, tim memotong 200 miligram jaringan dari paru-paru dan merebus sampel kecil, menyebabkan molekul-molekul lengket di dalam terlepas tanpa merusak RNA.
Tim kemudian membangun genom hampir lengkap dari RNA yang diselamatkan. Untuk lebih memperkaya model evolusi mereka, tim menjelajahi koleksi sampel genetik di Laboratorium Referensi Nasional Jerman dan menemukan dua sampel campak yang dikumpulkan pada tahun 1960 untuk menambah analisis mereka.
Tim membangun model evolusi mereka dari sampel 1912, sampel 1960 dan 127 sampel tambahan, yang paling banyak dikumpulkan pada atau setelah tahun 1990-an. Model kedua membandingkan sekitar 50 sekuens campak dengan virus rinderpest, yang dinyatakan diberantas pada 2011, dan peste des petits ruminans (PPRV) terdekat, yang menginfeksi kambing dan domba, untuk dijabarkan ketika patogen ini berpisah dari 'leluhur' mereka.
Berdasarkan ketika rinderpest dan campak menyimpang, tanggal paling awal untuk pembentukan campak dalam populasi manusia terjadi sekitar abad keenam SM, meskipun tanggal pasti bahwa virus yang pertama kali terinfeksi orang masih belum diketahui.
Para penulis mencatat bahwa, sekitar 2.000 hingga 2.500 tahun yang lalu, manusia mulai membangun permukiman yang cukup besar yang memberi kesempatan campak untuk berkembang. Campak cenderung mereda di komunitas kurang dari 250 ribu individu, karena penduduk dengan cepat menjadi kebal atau meninggal karena penyakit.
Calvignac-Spencer mengatakan bahwa dia tertarik untuk mengungkap sampel campak kuno, jika ada, untuk lebih menyempurnakan pemahaman kita tentang sejarah patogen.
Ikuti Whatsapp Channel Republika
